Научные направления кафедры осуществляются в сотрудничестве с крупными научными центрами стран СНГ и дальнего зарубежья. (Москва, Иваново, Санкт-Петербург, Киев, Тель-Авив, Лондон, Саратов) по результатам проведенных научно-исследовательских работ сотрудниками кафедры за эти годы было защищено 7 докторских диссертаций, 35 кандидатских диссертаций, опубликовано 22 монографий, более 2100 научных и учебно-методических статей, более 100 авторских и рационализаторских свидетельств, золотой медали выставки достижений народного хозяйства (ВДНХ) в 1985 году за достижения в науке.
Научная работа, проводимая учеными кафедры, всегда была тесно связана с подготовкой научно–педагогических кадров и требованиями практического здравоохранения, а также направлена на решение проблем, определенных государственной программой развития науки и технологий "Охрана здоровья матери и ребенка, разработка методов диагностики, лечения и профилактики с учетом региональных особенностей, внедрения в учебную практику интерактивных методов обучения и виртуальнные лаборатории" данные направления являются проблемными темами кафедры.
По итогам научно-исследовательской работы, завершенной за последние 3 года, была защищена диссертация PhDпреподавателем кафедры БайкуловымА.К., сотрудниками кафедры опубликовано более 60 научных работ,40 за рубежом, в том числе 6 статьи на платформе Scopus
Кафедра осуществляет свою научную деятельность согласно договоров-меморандумов с Южно-Казахстанской медицинской академией,НИИ паразитологии им. Исаева (Самарканд), кафедрами Самми. В частности, ассистент Файзуллаева Х.Б. в качестве независимого исследователяпроводит научную работу на тему "прогностическая информативность клинико-лабораторных показателей у новорожденных с асфиксией" Саттарова Х.Г., и Ахмедов А.С. темы своих научных исследований проводят совместно с сотрудниками НИИ паразитологиии им. Исаева (Самарканд) Результаты научных работ публикуются в престижных журналах в качестве статей. Ассистенты кафедры Ташмуродов Д.А., Мамадалиева З., Саидмуродова З. также являются сомостоятельными соискателями и выполняют свои диссертационные исследования.
Следует отметить, что впервые в истории кафедры благодаря усилиям руководства СамГМУ в сотрудничестве с Белорусским государственным медицинским университетом был объявлен конкурс на магистратуру по направлению медицинская биохимия и Ахмедов Амед Суюнович успешно прошел экзамены и окончил магистратуры по совместной программе. За короткое время Ахмедов А.С. в сотрудничестве с НИИ паразитологии им. Исаева защитил магистерскую диссертацию на тему "Разработка методов диагностики хронического воспаления тонкой кишки на основе цитокинового статуса".
