Кафедра патологической анатомии была создана постановлением Правительства Республики Узбекистан № 103 от 28 августа 1931 года. Первым заведующим и организатором кафедры был профессор Сергей Федорович Татаренчик. С 1924 года работал прозектором в Ташкенте, а с 1926 года работал ассистентом кафедры патологической анатомии медицинского факультета СамГУ. В 1931 году ему было присвоено звание профессора патологической анатомии, и он был направлен заведующим вновь созданной кафедрой патологической анатомии Самаркандского медицинского института. В этой должности он проработал до 1941 года. До наших дней в музее кафедры патологической анатомии сохранилось гипертрофированное сердце профессора С.Ф.Таренчика, массой 1000 грамм. Под его руководством двое сотрудников кафедры защитили диссертации (В.М. Копецкий, 1932 г. и Е.Н. Семенова, 1935 г.). В 1942-1944 годах работал на кафедре патологической анатомии Ленинградской высшей военно-медицинской академии под руководством академика Н.Н.Аничкова. Они работали в тесном взаимодействии со специалистами кафедры СамМИ и, несмотря на военное время, оказывали большую поддержку сотрудникам кафедры.
Кафедра патологической анатомии была создана в 1931 г., а первым заведующим кафедрой стал профессор Сергей Федорович Татаренчик. Под руководством профессора С. Ф. Татаренчика, были защищены докторские и кандидатские диссертации В. И. Копецкого (1932) и Е. Н. Семенова (1935). В настоящее время сотрудниками кафедры подготовлено более 217 макропрепаратов и 3000 микропрепаратов, составивших основу музея кафедры.
В 1941-1945 годах кафедру возглавлял профессор Дмитрий Моисеевич Хаютин. В 1941-1944 годах кафедра работала с временно эвакуированной кафедрой патологической анатомии Ленинградской военно-медицинской академии (Россия) (заведующий, профессор Н.Н. Аничков).
В 1945-1951 годах кафедру возглавляла доцент Семенова Елизавета Николаевна.
В 1951-1958 годах кафедру возглавлял профессор Асадулло Икромович Магрупов. Под его руководством защитили кандидатские диссертации Т.М.Патрушева (1953), О.М.Азизова (1958), Ф.А.Абдухаликов (1961), А.А.Ростовцев (1963). Профессор А.И.Магрупов также работал деканом лечебного факультета СамМИ в 1953-1958 гг.
В 1958-1968 годах кафедру во второй раз возглавила доцент Семенова Елизавета Николаевна. В это время защитили кандидатские диссертации С.А.Гамиянц (1966), М.И.Молдавский (1965).
С 1968 по 1995 год - в течение 27 лет кафедрой патологической анатомии бессменно руководила профессор Олия Муминовна Азизова. За время работы заведующей кафедры, профессора Азизовой О.М., среди сотрудников кафедры было защищено 2 докторских и 9 кандидатских диссертаций.
М.И.Молдавский
Докторские диссертации - М.И.Молдавский в 1980 г. и О.М.Азизова в 1981 г.; кандидатские диссертации - Д.Р.Кулдашев, 1969 г.; И.Н.Норбоев, 1970 г.; Ж.Б.Ахметов, 1971 г.; В.С.Романенко,1971 г.; Т.Д.Эшкабилов, 1972 г.; О.Б.Бобоходжаев, 1974 г.; Д.Й.Байгилдина (Ходжаева), 1974 г.; Р.С.Будагов, 1975 г.; Р.К.Болтабаев, 1980 г.;
В 1995-2003 годах кафедру возглавлял профессор Кулдашев Давлат Расулович. За эти годы была защищена одна кандидатская диссертация (Исламов Ш.Э. 2001).
Эшкабилов Тура Джураевич, кандидат медицинских наук, доцент. В 2003-2005 годах заведовал кафедрой патологической анатомии. Под авторством доцента Т.Ф.Эшкабилова опубликовано 2 монографии, 6 учебно-методических пособий и более 200 научных работ.
Абдуллаев Бахтиёр Саидович - кандидат медицинских наук, доцент. С сентября 2005 г. - заведующий курсом патологической анатомии, а с декабря 2007 г. по 2015 г. - декан медико-педагогического факультета. В мае 2005 года кафедра патологической анатомии была объединена с кафедрой судебной медицины и переименована в кафедру судебной медицины с курсом патологической анатомии. С этого времени кафедру возглавил доцент Бахтиёр Саидович Абдуллаев. За период, когда кафедрой руководил доцент Б.С.Абдуллаев, среди сотрудников кафедры была защищена одна кандидатская диссертация (Хамидова Ф.М. 2011). Доцент Абдуллаев Б.С. является автором одного учебника, одного патента на изобретение, более 60 научных работ.
Фарида Муйиновна Хамидова, кандидат медицинских наук, доцент. С 2015 года возглавляет кафедру. За этот период защищены 3 диссертации доктора философии (PhD) по медицинским наукам (З.Э.Жуманов, 2019; М.И.Камалова, 2022; Ж.Ш.Бекназаров, 2022). С сентября 2020 года курс патологической анатомии выделен из состава кафедры судебной медицины, и курс патологической анатомии стала функционировать как отдельная кафедра с курсом секционной биопсии.
В настоящее время на кафедре работают доцент Ф.М.Хамидова, доцент Т.Д.Эшкабилов, доцент Б.С.Абдуллаев, доцент З.Э.Жуманов, доцент Ш.Э.Исламов, ассистенты К.Н.Уроков, Г.У.Аманова, Ж.М.Исмоилов, А.М.Норжигитов, С.Д.Бобоназаров, М.А.Уринова, Х.А.Рахмонов, О.О.Орипова, Ф.А.Умарова.
Кафедра расположена на 1 этаже морфологического корпуса клиники СамГосМУ и состоит из лекционного зала на 60 мест, 14 аудиторий, двух лабораторий, музея с экспонатами, состоящими из 850 макропрепаратов и 6000 микропрепаратов. В отделении имеется система телемедицины, подключенная к сети Интернет. С помощью этой системы налажена постоянная связь с Республиканским патологоанатомическим центром и патологоанатомическими лабораториями во всех регионах Республики. Кроме того, можно связаться с аналогичными лабораториями в других странах для обмена опытом и советами.