Кафедра «Фармация» была создана в 2018 году в составе педиатрического факультета. Позже по приказу ректора Самаркандского государственного медицинского института Ризаева Ж.А. с 3 июля 2020 года No 543 / AF создан фармацевтический факультет и деканом факультета назначен доктор медицинских наук, профессор Н.М. Шавази. На факультете действует 5 кафедр (фармакология, клиническая фармакология, фармакогнозия и фармацевтические технологии, биологическая химия и медицинская химия).
Из 68 преподавателей, работающих на факультете, 17 (23,4%) имеют ученые степени, в том числе 2 доктора наук (3,0%), 10 кандидатов наук (15%).
По состоянию на сентябрь 2021 года на факультете обучаются 586 студентов, из них 469 - на контрактной основе. Языки обучения: узбекский, русский и английский, 5510500 - «Фармация» в соответствии с квалификационными требованиями. При организации учебного процесса особое внимание уделяется неукоснительному соблюдению учебной и трудовой дисциплины, повсеместному внедрению передовых педагогических технологий в педагогическую практику, повышению качества и эффективности обучения на кафедрах факультета. Заместители декана Г.Г.Ганиев, Б.А.Джураев стараются изучить жизнь каждого ученика, оказать необходимую помощь, встретиться с родителями учеников для выполнения этой сложной повседневной работы.
Рационализация работы деканата, введение должности заместителей декана по каждому направлению повысила показатели посещаемости студентов факультета на каждый семестр не менее 99,5 - 99,7%, освоение дисциплин составляет 75-80 % и продолжает улучшаться. Большое внимание уделяется работе с талантливыми студентами, так, в 2021 году более 75 студентов были приняты в ряды одаренных студентов, которые активно участвуют в работе студенческих научных кружков, участвуют в республиканских олимпиадах и республиканских научных конференциях и награждены дипломами.